Ancak, SMS onayının da bazı dezavantajları bulunmaktadır. Örneğin, bazı durumlarda cep telefonu şebekesi zayıf olabilir veya kullanıcılar yurt dışında seyahat ederken erişim sorunları yaşayabilirler. Ayrıca, SMS'lerin gizliliği ve güvenliği konusunda endişeler bulunmaktadır, çünkü SMS'lerin içeriği genellikle açık bir şekilde iletilir ve bu da potansiyel olarak kötü niyetli kişilerin erişimine açık olabilir.
